韩国反恐局最优秀特工李正宇（郑雨盛 饰）偶遇情报局展厅向导尹惠仁（秀爱 饰），被其深深吸引，无奈屡屡示好均被冰山美人果断拒绝，不解之余渐渐感觉到惠仁身上似乎有别样身世迫其努力与他人保持距离。　　时值韩国自主研发最新核反应堆关键时刻，而这一消息对名为“雅典娜”的组织而言则如惊天霹雳，此秘密存在的组织一直掌控着全球能源市场，为保住其统治地位，不惜发动恐怖袭击甚至挑起战争。此次韩国成了他们的眼中钉，为达目的，组织动用了其核心成员，安插在美国情报局东亚分部的部长孙赫（车胜元 饰）利用职务之便，不惜一切阻止韩国的研发进程，必要再掀一番血雨腥风。　　孙赫佯称协助韩方工作被美国情报局派回韩国，即刻开始大规模网罗整个东亚关于核反应堆研发的最新情报，甚至大开杀戒，铲除一切了解雅典娜组织，或是被韩国反恐局发现的组织成员。不断发生的离奇案件引起了反恐局的怀疑，通过追查线索，发现被杀嫌犯的同伙现在意大利维琴察有进一步图谋。李正宇及其前辈金基秀（金民钟 饰）被派往维琴察调查真相。本来毫无头绪的李正宇经历一波波偷袭，最后终于发现对方的目标竟是绑架隐姓埋名在维琴察读书的韩国总统独生女……

韩国情报机构NSSTF-A队，是一只实力颇强的情报队伍。队长郑柳建（张赫饰）能力极强，但似乎暗藏着什么秘密；队员池秀妍（李多海饰）拥有超强的射击能力，平日里虽然经常不在状态，关键时刻却能积极发挥自己的作用，是位不可或缺的女队员；而NSS的副局长崔敏则是美国五角大楼的超强出身，她奔走于谈判场合，是NSS改革团队的绝对核心。为了解决围绕在“白山”背后的谜团，NSS展开了一系列的调查和搜索，而故事的真相极其复杂和出人意料。队长柳建也不可抗力的被卷入了这些事情中，改变了自己的人生轨迹……本片是《IRIS》的后续故事，第一部由李秉宪和金泰熙分别出演男女主角。《IRIS II：新一代》探索了《IRIS》和《雅典娜：战争女神》的后续事件。该故事探讨了前国家安全局局长兼 IRIS 特工白山（金英哲 饰）和主角郑有根（张赫 饰）的渊源。特工金贤俊（李秉宪饰）被 IRIS 特工雷（大卫·李·麦金尼斯 饰）的狙击枪射杀后），IRIS 进入缓解期以恢复和侦察。三年过去了，国家安全局不再像以前那样是一个秘密的黑色行动部门；它现在是世界的公共实体。然而，成为国家安全局监督者的国家安全局局长（由于白山滥用权力，他从未批准国家安全局的存在）削弱了该组织的能力，并将其限制在监管和控制联邦犯罪方面，例如关闭武器走私团伙。正是在这段时间，国家安全局现任局长注意到郑裕健警官，并让他训练一批新的国家安全局特工来应对未来的国家威胁。