居住在宁静的孤岛·伊那国岛的少年们，突然遭遇了足球部废部的危机。取回足球的条件是，在FootballFrontier的比赛中取得一胜。主人公·稻森明日人等人离开了岛，进入雷门中学并向FootballFrontier发起挑战。伊那国·雷门十一人初战的对手，是排名第一的“星章学园”……

动画以被神秘的外星人德拉克特毁灭了几乎所有人类的地球为舞台展开。过去人类为了躲避外星人而藏身的避难所伊克西亚，毁灭之日的记忆被抹去的居民们什么都不知道地过着普通的生活。但是住民中也有一部分的“被选中的人”们，驾驶着名为罗格的巨大机器人与外星人战斗着……

飞向世界！最强的十一人开始！最后“迈向世界的大门”开启了！足球日本代表“闪电日本”终于宣布了！ 其中包括稲森明日人，灰崎凌兵，野坂悠马。 来自不同学校的菁英选手聚集在一起。 此外还增加了一个与海外日本籍选手一起比赛的新手“一星充”，现在国家足球队日本代通往世界的船将驶向大海了。然而等待着是远远超过他们预期的试炼。 神秘的组织“俄里翁的使徒”，策略，背叛，冲突---。 大家期待的世界足球大赛FFI（国际级水平明日之星足球大赛）现在开始。闪电日本！飞向世界！